Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms