Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms