Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms