Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nphp1Q9QY53 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nphp1Q9QY53 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nphp1Q9QY53 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Nphp1Q9QY53 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nphp1Q9QY53 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nphp1Q9QY53 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nphp1Q9QY53 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nphp1Q9QY53 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nphp1Q9QY53 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nphp1Q9QY53 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nphp1Q9QY53 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nphp1Q9QY53 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nphp1Q9QY53 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nphp1Q9QY53 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nphp1Q9QY53 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nphp1Q9QY53 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nphp1Q9QY53 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nphp1Q9QY53 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nphp1Q9QY53 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms