Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan3Q9QY33 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan3Q9QY33 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan3Q9QY33 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan3Q9QY33 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan3Q9QY33 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan3Q9QY33 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan3Q9QY33 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan3Q9QY33 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan3Q9QY33 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan3Q9QY33 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan3Q9QY33 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan3Q9QY33 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan3Q9QY33 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan3Q9QY33 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan3Q9QY33 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan3Q9QY33 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms