Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms