Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms