Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms