Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms