Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms