Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms