Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcea2Q9QVN7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms