Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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