Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms