Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM05

Pias4, E3 SUMO-protein ligase PIAS4, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias4Q9JM05 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pias4Q9JM05 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pias4Q9JM05 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms