Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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