Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tgm1Q9JLF6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tgm1Q9JLF6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tgm1Q9JLF6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tgm1Q9JLF6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tgm1Q9JLF6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm1Q9JLF6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tgm1Q9JLF6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm1Q9JLF6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm1Q9JLF6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tgm1Q9JLF6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm1Q9JLF6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm1Q9JLF6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm1Q9JLF6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm1Q9JLF6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm1Q9JLF6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm1Q9JLF6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm1Q9JLF6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm1Q9JLF6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm1Q9JLF6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm1Q9JLF6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm1Q9JLF6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm1Q9JLF6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm1Q9JLF6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm1Q9JLF6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms