Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gde1Q9JL56 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms