Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms