Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx5Q9JKQ4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx5Q9JKQ4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms