Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms