Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem1Q9JKE2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms