Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx3Q9JKB3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms