Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms