Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms