Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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