Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bco1Q9JJS6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Bco1Q9JJS6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Bco1Q9JJS6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Bco1Q9JJS6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Bco1Q9JJS6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bco1Q9JJS6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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