Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms