Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efcc1Q9JJF6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms