Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms