Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms