Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms