Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI18

Lrp1b, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 4,599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp1bQ9JI18 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lrp1bQ9JI18 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms