Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EefsecQ9JHW4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms