Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tmod3Q9JHJ0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Tmod3Q9JHJ0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Tmod3Q9JHJ0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Tmod3Q9JHJ0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Tmod3Q9JHJ0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Tmod3Q9JHJ0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Tmod3Q9JHJ0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Tmod3Q9JHJ0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Tmod3Q9JHJ0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod3Q9JHJ0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Tmod3Q9JHJ0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Tmod3Q9JHJ0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms