Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcirg1Q9JHF5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms