Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms