Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
Rb1cc1Q9ESK9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms