Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc4Q9ES56 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc4Q9ES56 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms