Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc28a3Q9ERH8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc28a3Q9ERH8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc28a3Q9ERH8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc28a3Q9ERH8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc28a3Q9ERH8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc28a3Q9ERH8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc28a3Q9ERH8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc28a3Q9ERH8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc28a3Q9ERH8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc28a3Q9ERH8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc28a3Q9ERH8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc28a3Q9ERH8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc28a3Q9ERH8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc28a3Q9ERH8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc28a3Q9ERH8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc28a3Q9ERH8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc28a3Q9ERH8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc28a3Q9ERH8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc28a3Q9ERH8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc28a3Q9ERH8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Slc28a3Q9ERH8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc28a3Q9ERH8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms