Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Rapgef4Q9EQZ6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Rapgef4Q9EQZ6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Rapgef4Q9EQZ6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Rapgef4Q9EQZ6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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