Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms