Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SgshQ9EQ08 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms