Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD03

Rab13, Ras-related protein Rab-13, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab13Q9DD03 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab13Q9DD03 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab13Q9DD03 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab13Q9DD03 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab13Q9DD03 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab13Q9DD03 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab13Q9DD03 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab13Q9DD03 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rab13Q9DD03 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rab13Q9DD03 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rab13Q9DD03 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab13Q9DD03 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms