Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms