Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmg20aQ9DC33 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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