Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms