Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9DA42 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9DA42 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9DA42 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9DA42 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9DA42 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9DA42 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9DA42 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9DA42 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9DA42 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9DA42 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9DA42 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9DA42 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9DA42 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9DA42 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9DA42 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9DA42 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9DA42 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9DA42 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9DA42 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9DA42 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9DA42 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9DA42 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9DA42 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9DA42 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9DA42 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9DA42 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9DA42 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9DA42 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9DA42 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9DA42 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9DA42 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9DA42 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9DA42 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9DA42 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9DA42 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9DA42 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9DA42 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9DA42 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9DA42 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9DA42 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9DA42 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9DA42 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9DA42 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9DA42 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9DA42 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9DA42 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9DA42 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9DA42 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9DA42 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9DA42 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9DA42 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9DA42 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9DA42 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9DA42 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9DA42 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9DA42 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9DA42 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9DA42 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9DA42 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9DA42 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms