Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmbim4Q9DA39 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmbim4Q9DA39 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms