Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd8Q9DA37 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms